【OpenPBS】PBS_Server not running を解消する

OpenPBS でPBS_Server がrunning にならない

今日はジョブスケジューラの話を。

顧客のクラスターサーバーでPBS Pro を使うケースがたまにあるのですが、こちらで動作確認する環境が欲しくても商用のジョブスケジューラなので買えない。ということで互換性があるOpenPBS の環境を構築することがあったのですが、情報が少なくて結構ツボにはまるので備忘録です。

1台でヘッドノードと計算ノードを兼ねるので、SERVER、SCHED、COMM、MOM を全て1 にします。

sudo vi /etc/pbs.conf 

編集後のファイル

PBS_SERVER=HOSTNAME 

PBS_START_SERVER=1 

PBS_START_SCHED=1 

PBS_START_COMM=1 

PBS_START_MOM=1 

PBS_EXEC=/opt/pbs 

PBS_HOME=/var/spool/pbs 

PBS_CORE_LIMIT=unlimited 

PBS_SCP=/usr/bin/scp Code language: JavaScript (javascript)

これで

sudo /etc/init.d/pbs start

でPBS を開始させるも、PBS_SERVER だけが起動しません。

sudo /etc/init.d/pbs status 

結果

pbs_server is not running 

pbs_mom is pid 68210 

pbs_sched is pid 68222 

pbs_comm is 68200 

ログが出ずに原因が分からなかった

/var/spool/pbs/server_logs などのログを確認したのですが、原因が分からず。。。

参考になったのはこちらのリンク。

If PostgreSQL data (/var/spool/pbs/datastore) created, and the server db has not row (cannot be loaded at startup (rc=1)) , then pbs_server.bin seems to exit. 
(No log messages are output.) 

ということで、datastore ディレクトリを削除してみると、

sudo rm -r /var/spool/pbs/datastore/ Code language: JavaScript (javascript)

動くようになりました。警告は出ていますが。

% sudo /etc/init.d/pbs start 

Starting PBS 

PBS Home directory /var/spool/pbs needs datastore. 

Running /opt/pbs/libexec/pbs_habitat to initialize it. 

*** 

*** Setting default queue and resource limits. 

*** 

cp: cannot stat '/usr/pgsql-15.10/lib/*': No such file or directory 

cp: cannot stat '/usr/pgsql-15.10/lib/*': No such file or directory 

cp: cannot stat '/usr/pgsql-15.10/share/timezonesets/*': No such file or directory 

cp: cannot stat '/usr/pgsql-15.10/share/timezonesets/*': No such file or directory 

cp: cannot stat '/usr/lib/postgresql/15/bin/pg_resetxlog': No such file or directory 

*** End of /opt/pbs/libexec/pbs_habitat 

Datastore directory /var/spool/pbs/datastore initialized. 

/opt/pbs/sbin/pbs_comm ready (pid=805735), Proxy Name:XXX.domain.com:17001, Threads:4 

PBS comm 

PBS mom 

PBS sched 

Connecting to PBS dataservice...connected to PBS dataservice@XXX.domain.com 

PBS server Code language: JavaScript (javascript)

ステータスを確認しても問題なしです。

sudo /etc/init.d/pbs status 

pbs_server is pid 805855 

pbs_mom is pid 805745 

pbs_sched is pid 805758 

pbs_comm is 805735